Per poter assolvere al proprio mandato il Dipartimento è organizzato in 6 Divisioni e 19 Laboratori:
- Smart Energy
- Fotovoltaico e Smart Devices
- Produzione, Storage e Utilizzo dell’Energia
- Solare Termico, Termodinamico e Smart Network
- Sviluppo di Sistemi per l’Informatica e l’ICT
- Bioenergia, Bioraffineria e Chimica Verde
Alle Divisioni si aggiungono Unità di Supporto Tecnico e Unità di Gestione Tecnico Funzionale:
- Sezione Supporto Tecnico Strategico (TERIN-STS)
- Sezione Strumenti per Applicazioni Energetiche (TERIN-SAEN)
- Sezione per la conservazione e la Gestione Digitale (TERIN-CGD)
- Servizio Risorse Umane e Funzionamento (TERIN-RUF)
- Servizio Amministrazione Ciclo Passivo (TERIN-ACP)
- Servizio Supporto Tecnico e Pianificazione Operativa (TERIN-STP)